Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms