Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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USP43Q70EL4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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USP43Q70EL4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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USP43Q70EL4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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USP43Q70EL4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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USP43Q70EL4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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USP43Q70EL4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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USP43Q70EL4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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USP43Q70EL4 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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