Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC149Q6ZUS6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC149Q6ZUS6 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms