Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms