Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSSK4Q6SA08 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms