Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRAMD4Q6IC98 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms