Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COL5A1-AS1Q5SY13 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms