Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIN4Q56A73 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms