Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ALFQ53S48 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms