Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKDCCQ504Y2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms