Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC39A12Q504Y0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A12Q504Y0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms