Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms