Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TWISTNBQ3B726 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms