Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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