Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SGCBQ16585 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SGCBQ16585 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SGCBQ16585 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SGCBQ16585 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SGCBQ16585 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SGCBQ16585 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SGCBQ16585 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SGCBQ16585 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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