Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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