Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCOA1Q15788 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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