Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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CDSNQ15517 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CDSNQ15517 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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