Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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