Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUM3Q15397 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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