Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PTPRRQ15256 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PTPRRQ15256 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PTPRRQ15256 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PTPRRQ15256 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PTPRRQ15256 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRRQ15256 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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