Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC3Q15034 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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