Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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