Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms