Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CHD4Q14839 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CHD4Q14839 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CHD4Q14839 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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CHD4Q14839 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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CHD4Q14839 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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CHD4Q14839 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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CHD4Q14839 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHD4Q14839 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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