Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms