Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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