Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HNF4GQ14541 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms