Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms