Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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