Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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