Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATP1A4Q13733 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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