Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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