Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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