Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNW1Q13573 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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