Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms