Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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