Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TOP3AQ13472 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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