Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms