Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM2Q13029 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM2Q13029 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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