Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RBBP4Q09028 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms