Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLFN5Q08AF3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms