Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms