Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms