Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FMODQ06828 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms