Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRF8Q02556 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms