Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TUBB4BP68371 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB4BP68371 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms