Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms