Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVPABLB-1P60509 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVPABLB-1P60509 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms