Protein–RNA interactions for Protein: P54756

EPHA5, Ephrin type-A receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA5P54756 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EPHA5P54756 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms